二氧化氯粉劑是一種優良的消菌劑, 具有較好的殺滅作用, 能消滅對多種疾原微生物的傳播, 除一般的二氧化氯能除去的菌外, 二氧化氯對孢子、異養菌、鐵菌、硫酸鹽還原菌等多種菌類都有良好的殺滅效率, 而且不易產生耐劑性, 二氧化氯對疾疫的滅活比臭氧和氯氣越有用, 低劑量二氧化氯也有很強的殺滅蠕蟲作用。

　　二氧化氯在水中溶解時, 不與水發生反應, 也不存在兩種聚合或縮聚狀態, 水的擴散速度和滲入速度比氯快, 格外是在低濃度時, 當菌濃度在105 - 106 /毫升, ClO2 0.5ppm 5分鐘消滅越過99 %的菌；并且氯氣消菌率多達75%, 試驗表明, 在12個小時的異養菌的殺滅率二氧化氯保持在99 %左右, 多達24小時的消菌作用時間率下降到86.3%。

　　急性口部菌質試驗表明, 二氧化氯粉劑屬優良產品, 累積試驗結論為弱蓄積性物質, 口部粘膜、皮膚和頭皮的損害不受水的消菌, 急性疾疫和遺傳疾理學是全的。

　　近年來, 二氧化氯粉也被常用于溫泉消菌, 可以減少降塵引起的菌污染和增殖, 然而, 由于泉水短缺, 缺乏溫泉水的人往往采用流動過濾加熱的方法, 而不考慮加熱會導致管道中生物膜的形成, 引起菌增殖。

　　一般溫泉水中的二氧化氯濃度達到0.8mg/l, 可以維持整天的使用, 而臭氧、過氧化氫、紫外線照射等消菌方法是暫時的, 不具有維持沒有菌的狀態作用, 因此, 二氧化氯粉劑在溫泉消菌中比其他消菌劑和普通氯制劑具有越多的優點, 是溫泉消菌定選的消菌劑。